Luego de la eliminación de Millonarios y Junior de la actual edición de la Copa Libertadores, La Dimayor dio a conocer la conformación de los grupos que harán parte de la Copa Águila 2017, torneo que enfrenta a conjuntos de primera y segunda división de nuestro país y otorga un cupo a la fase inicial del torneo  de clubes más importante del continente.

La espera para definir los enfrentamientos se debía a la posibilidad de que alguno de los equipos mencionados quedara sembrado en segunda fase del torneo, pero al no darse esta situación, el cupo se definió por puntaje de reclasificación, siendo Millonarios el beneficiado.

Así las cosas, Once Caldas quedó instalado en el grupo B del torneo, con los equipos jóvenes de Antioquía (Envigado y Rionegro Águilas) como ocurrió en el año anterior, con la diferencia que enfrentará a Leones de Itagüi en reemplazo de Independiente Medellín que ya está clasificado a segunda ronda por su participación en copa Libertadores. Pereira y Quindío hacen parte del grupo H con Huila y Deportes Tolima.

La fase de grupos iniciará actividad el 8 de Marzo con 32 equipos, de los cuales clasifican los 8 primeros y los 4 mejores segundos, que conformarán los octavos de final a disputarse a partir de julio, con los ya clasificados Millonarios, Santa Fe, Medellín y Atlético Nacional.