‘Pacho’ Maturana logró la Copa Libertadores con Atlético Nacional, el campeonato colombiano con América de Cali y la clasificación de Colombia al Mundial de 1990; pero de ahí en adelante ha cosechado más derrotas que triunfos.
En 1994 fue contratado por el Atlético de Madrid, allí duro únicamente 10 partidos, debido a que fue despedido por su mal rendimiento.
De ahí pasó a la selección ecuatoriana, donde disputó la Copa América de 1995, quedando eliminado en fase de grupos, siendo apartado del cargo más adelante al no clasificar al Mundial. Nuevamente regresó al fútbol colombiano, esta vez a dirigir a Millonarios en 1998, cosechando un nuevo fracasó en su carrera deportiva, ubicando al conjunto azul en la décima posición del campeonato.
Tuvo dos pasos fugaces por las selecciones de Costa Rica, en la cual solo dirigió 11 partidos y Perú, donde no tuvo buenos desempeños y fue destituido después de una derrota frente a Argentina. En 2001 volvió a la Selección Colombia siendo campeón de la Copa América y dejando posteriormente el seleccionado al no clasificar al Mundial de Corea y Japón 2002.
Tras un paso por Arabia Saudita en el Al-Hilal, en el cual renunció, nuevamente se hace cargo de la selección nacional en 2003, siendo destituido del cargo tras caer derrotado con Argentina, Bolivia y Venezuela por Eliminatorias Sudamericanas.
En 2004 tuvo un paso poco exitoso por Colón de Argentina, donde únicamente disputo el torneo clausura, ubicando al equipo al final de la tabla. Asimismo, hizo parte en 2007 de Esgrima de la Plata quedando de último en el torneo argentino.
Maturana dirigió a Trinidad y Tobago; allí tampoco clasificó al Mundial, esta vez fue el de Sudafrica 2010 y además dejó a la selección última en el hexagonal. Finalmente estuvo en el Al-Nassr de Arabia Saudita en el cual quedó subcampeón de la recopa 2011 y después fue despedido en el inicio del torneo de 2012.
Ahora, Francisco Maturana tras su regresó a la dirección técnica, está al borde de un nuevo fracaso, pues ubica al Once Caldas en la posición 17 con 13 puntos de 36 posibles.
